杀菌锅从控制方式上分有5种，分为手动控制型、电气自控型、电脑自控型、电脑半自动控制型、电脑全自动控制型（远程控制型）等。

从杀菌方式上分为3种：水浴式杀菌、蒸汽式杀菌、喷淋式杀菌。

从罐体结构上分有7种：单罐杀菌锅、双层杀菌锅、双锅并联式杀菌锅、三锅并联式杀菌锅、立式杀菌锅、电汽两用杀菌锅、旋转式杀菌锅。